Die Kernaktivität der Fondation Agapetos besteht in der Unterstützung und Finanzierung von humanitären Projekten und Aktionen, insbesondere zugunsten von christlichen Gemeinschaften und verfolgten Christen, vor allem im Nahen Osten. Die Fondation konzentriert sich auf die Bereiche Bildung, Ernährung, Gesundheit, Unterkunft und soziale Unterstützung. Sie agiert sowohl auf lokaler als auch auf internationaler Ebene und verfolgt das Ziel, bedürftigen Bevölkerungsgruppen zu helfen und ihnen die Möglichkeit zu geben, sich selbst zu stärken und nachhaltig zu entwickeln.