Die Kernaktivität der Karl Näf Stiftung besteht in der Förderung von drei Hauptbereichen:
1. **Nachhaltige Energiegewinnung**: Die Stiftung unterstützt die Entwicklung von umweltfreundlichen Energiegewinnungsmethoden, insbesondere die geothermische Energiegewinnung in der Schweiz.
2. **Pflanzenzucht**: Die Stiftung fördert die Auszeichnung von besonderen züchterischen Leistungen im Bereich des fortschrittlichen Gemüsebaus und unterstützt die Entwicklung von Pflanzenzüchtungen, die der schweizerischen Allgemeinheit dienen.
3. **Kultur**: Die Stiftung unterstützt kulturelle Zwecke, insbesondere die Erhaltung von Kunstgegenständen, geschichtlichen und archäologischen Kulturgütern in der Ostschweiz, sowie die Unterstützung eines Ortsmuseums in Goldach.