L'activité principale de l'entreprise Ecoptere consiste en une consultation scientifique et une recherche dans le domaine de la faune, en particulier dans l'étude et la protection des chiroptères (chauves-souris), des amphibiens, des reptiles, des oiseaux, des papillons et d'autres mammifères. L'entreprise propose des services tels que la gestion de projets, des études, des expertises et des conseils pour les administrations publiques, les associations et les entreprises privées, dans le but de promouvoir la conservation des espèces, la relation entre l'homme et la nature ainsi que la valorisation des habitats.