L'associazione ha lo scopo di rafforzare e unire i battisti sulla base della loro testimonianza cristiana e delle loro particolari convinzioni di fede, di incoraggiarli nella vita di fede, di promuovere la comunità e la responsabilità condivisa e di cercare di realizzare in ogni sforzo la volontà di Gesù Cristo, il Signore e il Salvatore. L'associazione è membro dell'Alleanza mondiale battista. Promuove i suoi interessi e sostiene i suoi obiettivi. L'EBF è in relazione con il Centro internazionale di studi teologici battisti con sede ad Amsterdam, che costituisce un'associazione separata sotto la legislazione olandese. L'EBF possiede gli investimenti di capitale per l'operazione di IBTSC (Amsterdam), che sono gestiti attraverso l'associazione Scuola teologica battista con sede a Rüschlikon ZH.