L'objectif de la fondation de l'Institut d'études sud-est européennes helvétique est de promouvoir la science et la recherche sur le sud-est de l'Europe en Suisse, l'éducation, la formation professionnelle et populaire, l'art et la culture, l'intégration, la protection de l'environnement, la santé publique et le sport. L'objectif statutaire est réalisé notamment par l'organisation d'événements scientifiques et de projets de recherche, ainsi que par l'attribution de mandats de recherche. L'Institut helvétique d'études sud-est européennes mène des recherches sur l'engagement de la Suisse dans les États d'Europe du Sud-Est ainsi que sur l'impact des migrations dans cette sphère sur la société, la politique, l'économie et la culture suisses. L'Institut pourra également offrir des programmes de bachelor et de master ainsi que des programmes de doctorat après avoir obtenu la licence des institutions officielles et académiques. L'Institut d'études sud-est européennes helvétique agit de manière désintéressée ; il ne poursuit pas en premier lieu des objectifs économiques propres.